La principial vía de acceso al nucleo urbano de Algete es a través de la salida 23 de la Autovía del Norte o A-1, continuando por la M-100 y posteriormente la M-106.

Para el acceso al distrito de Prado Norte, en la M-100 se toma la M-111 y después la antigua carretera de Fuente El Saz del Jarama.

Para acceder al distrito de Santo Domingo se toma la salida 28 de la Autovía del Norte o A-1.

La localidad cuenta con varias líneas de autobuses interurbanos que conectan sus distintos distritos con Madrid (Plaza de Castilla y Barajas), Alcobendas, Alcalá de Henares y otros municipios del norte de Madrid:

- Línea 171: Madrid (Plaza de Castilla) – Urb. Santo Domingo

- Línea 180: Alcobendas – Algete.

- Línea 181: Madrid (Plaza de Castilla) – Algete.

- Línea 182: Madrid (Plaza de Castilla) – Algete – Valdeolmos.

- Línea 183: Madrid (Plaza de Castilla) – Cobeña – Algete.

- Línea 184: Madrid (Plaza de Castilla) – El Casar.

- Línea 185: Madrid (Plaza de Castilla) – Nuevo Algete.

- Línea 197: Madrid (Plaza Castilla) – Torrelaguna – Uceda

- Línea 254: Valdeolmos – Fuente el Saz – Alcalá de Henares.

- Línea 263: Madrid (Barajas) – Cobeña – Algete.

- Línea N103: Madrid (Plaza Castilla) – Algete (Servicio Nocturno)